Ako silný oxidant,peroxid vodíka priemyselnej kvalitysa vo veľkej miere používa v odvetviach dezinfekcie a ochrany životného prostredia, ako je priemysel a potravinársky priemysel.
Keďže priemyselný peroxid vodíka obsahuje hlavne hydroxid OH- a sodíkový ión Na+, hydroxid sa môže kombinovať s mnohými kovovými iónmi a vytvoriť flocs alebo zrazeniny. Napríklad všetci vieme, že splaškové vody obsahujú kovové ióny, ako sú hliníkové ióny (Al3+) alebo ióny železa (Fe3+, Fe2+), silné kyslé soli a slabé kyslé soli, ktoré reagujú s OH- iónmi na výrobu flokov alebo rozpustných zrážok. Princíp flokulácie je hlavne kombinovať s hydroxidom radikálne OH- v odpadových vodách tvoriť Al (OH)3 flocculentné látky na dosiahnutie flokulačného účinku. Môže tiež odstrániť ióny s nadmernými radikálmi kyseliny v priemyselných odpadových vodách, ako je Cl-(SO4)2-(PO4)3 atď. Bežne sa používa aj na úpravu hodnoty PH a stanovenie dávky priemyselného peroxidu vodíka podľa situácie s PH.
Ochrana životného prostredia môže liečiť všetky druhy škodlivých odpadových vôd, vrátane detoxikácie, dezodorant a odfarbovanie, a je obzvlášť vhodný pre čistenie odpadových vôd obsahujúcich zlúčeniny síry, kyanidy a fenoly. Môže sa používať samostatne alebo v kombinácii s ozónom alebo ultrafialovým žiarením. Čistenie pôdy kontaminovanej uniknutým vykurovacím olejom alebo inou organickou hmotou peroxidom vodíka môže stimulovať opätovný rast mikroorganizmov, degradovať znečisťujúce látky a čistiť odpadové plyny obsahujúce NOx, SO2, H2S atď., ktoré môžu vytvárať užitočné koncentrované kyseliny dusičnej a koncentrovanej kyseliny sírovej. Peroxid vodíka môže tiež zlepšiť schopnosť biochemických metód čistenia odpadových vôd a zabrániť rozšíreniu kalov. Keď sa aktívne uhlie používané pri čistení odpadových vôd a odpadových plynov stane neplatným, môže sa regenerovať peroxidom vodíka.